자유지식인선언은 사학법 개정과 관련, 13일 성명서를 내고 "사학법 개정은 사학법인 운영권 침해로 사유재산제도와 학교자율권의 본질적 침해"라며 "자유를 사랑하는 모든 국민은 자유민주적 기본질서의 수호를 위해 궐기하자"고 주장했다. 자유지식인선언은 "사립학교는 사학법인의 사유재산"이라며 "재산출연자의 의사와 관계없이 외부이사를 선임하도록 강제하고 학교장 선임에 재산출연자의 친인척을 배제시키는 것은 국가기본질서의 핵심인 사유재산제 보장의 본질적 내용을 침해하는 것"이라고 밝혔다. 또 사학법인 외부이사 추천선임제에 관해서는 "정치적 투쟁집단인 전교조가 전국 사립학교법인 의사결정에 영향력을 행사하게 될 것"이라고 비판했다. 자유지식인선언은 "모든 국민, 모든 지식인, 모든 종교단체들은 개악 사립학교법에 대한 불복저항운동을 전개함으로써 우리가 사랑하는 대한민국의 자유민주적 기본질서의 수호에 나설 것"을 호소했다.
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